Odbor podpory regionálneho rozvoja sa podieľa na procese poskytovania dotácií z rozpočtovej kapitoly úradu na projekty subjektom územnej spolupráce podľa zákona o podpore regionálneho rozvoja. Plní úlohy a zabezpečuje činnosti vyplývajúce zo zákona o podpore najmenej rozvinutých okresov, a to najmä:
- vyhodnocuje plnenie akčných plánov,
- oznamuje Ústrediu práce, sociálnych vecí a rodiny ukončenie plnenia akčného plánu,
- spolupracuje s ministerstvami a ostatnými ústrednými a miestnymi orgánmi štátnej správy pri vykonávaní úloh vyplývajúcich zo zákona o podpore najmenej rozvinutých okresov a vládou schválených akčných plánov,
- podieľa sa na procese poskytovania regionálneho príspevku v súlade s vládou schválenými akčnými plánmi a ročnými prioritami okresu,
- podporuje a koordinuje činnosť okresných rozvojových centier,
- spolupracuje s okresnými úradmi najmenej rozvinutých okresov pri monitorovaní, koordinácii a vyhodnocovaní plnenia akčných plánov.