Hodnotenie programov financovaných z EÚ fondov je proces priebežného alebo následného posudzovania intervencií podľa ich výsledkov, vplyvu a miery, do akej spĺňajú potreby, ktoré majú za cieľ riešiť. Hodnotenie v EŠIF vykonáva centrálny koordinačný orgán, riadiace orgány v spolupráci s gestormi horizontálnych princípov a sprostredkovateľské orgány v zmysle európskej legislatívy.
Hodnotenia sa zameriavajú na efektívnosť, účinnosť, relevantnosť intervencií ako aj ďalšie kritériá. Hodnotenia môžu zahŕňať aj hĺbkové analýzy alebo prípadové štúdie slúžiace na preukázanie efektov politiky v konkrétnej situácii a kontexte.
Výsledky realizovaných hodnotení EÚ fondov sú publikované v Evaluačnej knižnici.